O estágio para estudantes de medicina dos últimos períodos (internato) é realizado neste Hospital por convênios que as escolas médicas celebram com o Núcleo Estadual do Ministério da Saúde (NERJ), depois de celebrado o convênio, o Centro de Estudos apresenta a sua planilha de vagas de acordo com a disponibilidade existente nas áreas básicas – Clínica Médica, Obstetrícia e Ginecologia, Pediatria e Cirurgia Geral onde os alunos se distribuem em rodízio, após o que o NERJ encaminha para este Centro de Estudos os nomes dos alunos indicados pelas suas respectivas escolas médicas.
Quando estes alunos chegam ao Hospital dos Servidores do Estado, o Centro de Estudos então implementa o projeto pedagógico segundo as diretrizes curriculares vigentes em comum acordo com as referidas escolas.
No momento existem 120 alunos das seguintes Escolas conveniadas, Faculdade de Medicina da Universidade Estácio de Sá, Faculdade de Medicina da Universidade Severino Sombra e Vassouras
A Divisão de Ensino e Pesquisa do H.F.S.E.. dispõe de vários Cursos e promove, diversos cursos de Aperfeiçoamento . anualmente, diversos eventos como Simpósios, Assembléias, Congressos, etc.
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